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微生物组学研究技能学习群
微生物组学技能培训系列课程
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数据与格式转换: 11个
序列处理: 23个
统计与绘图: 59个
表格处理: 8个
基因组与功能注释: 61个
比较分析: 10个
关系分析图: 6个
基因组可视化: 1个
基因组评估: 8个
数据下载: 4个
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微生物毒力基因VFDB数据库注释-Pro版
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基因组与功能注释
单基因序列进化树构建(mafft+fasttree)
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比较分析
gbk文件转换为gff3文件
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数据与格式转换
耐药突变位点分析(PointFinder)
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基因组与功能注释
质粒片段识别(PLASMe)
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基因组与功能注释
基于多序列比对文件生成SNP距离矩阵(snp-dists)
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比较分析
从gbk格式中提取基因组FastA序列
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序列处理
计算序列GC含量
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统计与绘图
基于FastA比对文件提取SNP位点(SNP_site)
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比较分析
MLST分析(批量注释)
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基因组与功能注释
真菌群落(ITS)功能预测(FUNGuild)
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基因组与功能注释
宏基因组数据真核序列识别(Tiara)
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基因组与功能注释
基于深度学习的基因注释工具(Helixer)
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基因组与功能注释
加权基因共表达网络分析 (WGCNA)
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统计与绘图
宏病毒组数据质量评估和前病毒检测
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基因组与功能注释
差异表达基因火山图
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环状热图绘制
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统计与绘图
细菌基因组下载(基于GCA/GCF-批量下载)
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细菌基因组下载(基于GCA/GCF-单次支持5个)
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数据下载
微生物基因组COG分类注释(批量处理)
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基因组与功能注释
RGI 预测核酸/蛋白质序列注释(批量处理)
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基因组与功能注释